產業結構調整，主要是壓縮紡織製陶等傳統工業的生產規模，同時大力扶植醫藥行業的發展。這符合行業發展規律，因爲行業的發展必然遵循由低級的自然資源掠奪性開採利用和低級的人工勞務輸出，逐步向規模經濟、科技密集型、金融密集型、人才密集型、知識經濟型；從輸出自然資源，逐步轉向輸出工業產品、知識產權、高科技人才等。
紡織業與製陶業可以說是輸出工業產品，是一種相對比較低級的粗放型規模經濟，市場不可能保持長久興盛，利潤也會逐漸降低。而醫藥行業是科技密集型產業，市場前景廣闊，利潤高，行業前景看好，將是一個新的經濟增長點。
除了能掙錢之外，醫藥業的發展也關係到民生大計。要知道，大華民國的公民也是需要各種醫療保健服務的，醫藥可以治病救人，可以防治瘟疫，是保障國民生命安全的堅固長城。
十數年來，萬磊征伐不斷，親手殺死的人就有數十，血積如山血流成河的血腥場面都見怪不怪了，可以說是天不怕地不怕，不過天地間還有讓他懼怕的東西，那就是瘟神。
瘟疫，就是由細菌病毒引起的大規模傳染病，往往發生在災區或者是衛生環境十分糟糕的地方，有史以來，大小瘟疫爆發了無數次，遠的不說，幾十年前，歐羅巴就爆發了大規模的黑死病，死亡人口數以千萬計，整個歐羅巴陷入了最黑暗的時期，現在還沒有恢復過來。黑死病還傳到了東方，連中原都有數以百萬計的人口死於這一場浩劫中。
瘟疫爆發，不只會奪去無數生命，甚至還會嚴重動搖一個國家的根基，很多文明古國都因爲大瘟疫而走向衰亡。作爲一個國家的締造者，萬磊對瘟疫的防治更加重視。
另外，作爲大總統，萬磊也深知，現在國民的平均壽命實在是太低，只有四十歲左右。要知道，從小學到中學再到大學，要培養出一個人才，最少也要十年，而這個人只能“使用”十幾二十年，“性價比”實在是太低，對國家而言，實在是一種人力資源的大浪費。
如果人均壽命提高到六七十歲，成年國民就有四五十年的時間來回報社會，從經濟學的角度上看，發展醫藥業，提高國民的人均壽命，這也是一種社會資源的最大化利用。
本着人盡其用的周扒皮精神，萬磊早在數年前就開始大力扶植醫藥研究，在崇道堂的生物研究院中，就下設有生物製藥研究所，專門研究古方和新藥，這幾年來也有很多成果。特別是從去年開始，海上探險隊從海外帶回很多動植物標本，這讓一些難治之症有了新的突破口。
比如說前往東洲的探險隊帶回來了一種植物，從中提取的一種生物鹼被證實對瘧疾有治療作用，肆虐人類歷史數千年的瘧疾有了真正的廣普藥，這種被命名爲金雞納霜的成品藥一旦量產推廣，國內因瘧疾而病死的人數將直線下降。
除了外來引進的金雞納霜之外，生物製藥研究所也在研究本土藥材，研究人員檢索過中醫古籍發現，本土中藥青蒿也具有治瘧療效，只是這種有效成分比較難提取，不如金雞納霜易於生產，所以短時間內還是以金雞納霜爲治瘧主藥。
金雞納霜的出現，不只是攻克了瘧疾這一種頑疾，對醫藥史而言還有非凡的意義，因爲這是第一種量產的廣譜藥，開啓了製藥業走向工業化現代化，以後人們治瘧疾，不用抓藥方，不用熬藥，只要用成品藥就行，方便又實用。
當然，醫藥業的工業化與現代化不等於就廢除掉中醫，實際上，萬磊對中醫的發展是採取大力扶持的態度了，畢竟醫學不同於一般的科學，這是一門經驗科學，不能一杆子打倒，也不能盲目崇拜，要去僞存真，在實踐中檢驗對錯。
在堅持中醫理論的基礎上，萬磊也要求中醫進行整體改革，畢竟事關人命，而中醫的從業人員中，參雜着一些庸醫神棍騙子，這也嚴重影響了中醫業的整個名譽，所以要進行行業整頓，把那些渣滓揪出去。
其中，中醫改革的重點就是設立醫師考評制度，只有通過考覈的人才發給醫師證，才能從事醫療業。同時成立中醫學院，對醫師進行綜合培訓，提高他們的醫術水平。
這種種舉措，都是在使中醫走向現代化。除了修正一些中醫理論外，也要進行一些理論革新，演生出病理學藥理學免疫學微生物學等新的理論學科，讓醫學更加科學化與系統化。
醫學的全面改革與振興是一項關乎國計民生的大事，也不是一蹴而就的事，萬磊只是開了一個頭，打一個基礎而已，未來的路還漫漫。不過，比起還處在黑死病統治下的歐羅巴來說，已經邁出了那堅實的一步，以後中醫學會更加輝煌。
從雨季到來，中原與臺島相繼爆發了小規模的時疫，其中以傷寒和瘧疾爲主，有數以萬計的人感染，不過發現及時，隔離與防治等措施得當，並未大規模感染。而且有了一些特效藥和處方，死難都並不多，比起往年來，算是一個了不起的進步了。
八月初十二，萬磊發表一份總統令，表彰各地的醫療工作者的同時，也頒佈了一份醫學發展規劃，決定於明天建立一所大型的醫科大學，號召青年學子積極投身到治病救人這一偉大的事業中。
八月十五日，萬磊乘坐火車來到金陵，參觀座落在八卦洲的特級醫藥研究所。八卦洲是位於金陵城北的一個江中島，特級醫藥研究院之所以設在這裡，是因爲它主要從事的是各種病毒與疫苗的研究，屬於高危領域，自然要隔離在孤島上，以免發生一些泄露事故。
特級醫藥研究所由妙詣領銜主管，下有數十位研究員，配有最先進的顯微鏡培養皿等實驗設備。同時，研究所實行高度隔離，八卦洲上還有一個營的駐兵，保證任何人不可靠近，就連萬磊進入，也要進行一套嚴格的檢查。
即便是要經過種種嚴格的檢查程序，萬磊還是覺得此行不虛，因爲據妙詣的指告，他們已經成功提取出一種可以抑制病菌生長的抗生素，真正打開了微生物學的大門。