得知李如鬆被困碧蹄館，距其最近的大將楊元率領一千精騎連夜趕來救援。此時的戰局並不明朗，明軍雖然兵力遠遠不及倭軍，可是並沒有崩盤，倭軍打得甚是辛苦。楊元部的到來，讓小早川隆景誤以爲是明軍的大部隊來援，在他看來和四千人對戰都已如此艱難，對方大部隊來了豈不是更加無力對抗，於是倭軍絲毫不敢戀戰，率軍退回了漢城。
碧蹄館之戰歷時一天一夜，明軍精騎死傷過半，倭軍也付出了數千傷亡的代價。此戰過後，李如鬆不敢貿然進軍，加上當時倭軍在漢城及周邊地區集結了五萬多人，單從雙方兵力對比上來看，倭軍有絕對的優勢，於是李如鬆決定退回開城修整。
之後明軍得到了錯誤情報：加藤清正率領的倭軍第二軍團將從咸鏡道進攻平壤，李如鬆便率領明軍從開城返回平壤，這導致了盟軍朝鮮軍隊剛剛收復的幸州得而復失。得知幸州失守後，李如鬆深悔自己退兵太急，不過戰場上瞬息萬變，誰都難免犯錯，一時的得失不算什麼，笑到最後的纔是勝利者。
明軍的戰況每隔三天就會有一封戰報發回國內，用的是八百里加急。此次的小小失利被朝廷上的一幫給事中們誇大其詞，紛紛要求萬曆皇帝降罪李如鬆，不達目的不罷休。萬曆皇帝心裡知道這些言官的目的並不單純，所說多半言過其實，無奈受不了他們的聒噪，只得下旨命李如鬆不得妄進，收到聖旨後，明軍只能更加謹慎了。
李如鬆知道倭軍不被打疼，他們是不會主動退卻的，除非找到對方的“命門”，給他們致命一擊。他召集所有的中高層將領天天開會，討論的就是這個問題，只是沒人能說出個靠譜點的策略。
這天的下午時分，鍾南見回營的施長廷又是愁眉不展，便知道今天的討論肯定還是沒結果，他走到上司身邊，隨意問了問，“將軍，還沒有定下方案嗎？”
“是啊，聖上又要求以穩爲重，所以沒有什麼太好的辦法。”參將大人很無奈。
“不能燒掉倭軍的糧草嗎？”鍾南問道。
“不是沒人提這個方案，只是一來不好確定糧草位置，二來就是燒糧草不可能派大隊人馬，人太少成功機率就太小，所以被否定了。”施長廷見鍾南如此發問，料定自己這個精明的小將當有奇思妙想，他試探着問：“你覺得這個方案可行？”
鍾南不敢託大，只是說“有可能”，施長廷便讓他先行講講，聽完後覺得大有道理，於是拉着鍾南來到了李如鬆的帥營。通報過後，兩人進了營帳，此時的李如鬆正坐在椅子上沉思，見人來到後立刻問道：“施參將有何良策？”
“不是我，是他想到的！”施長廷指着鍾南。
“哦……是何計謀？”
“燒糧草。”鍾南的回答簡單有力。
“可糧草在何處？”
“很簡單，之前朝鮮軍的大糧倉在哪裡如今倭軍的糧草就在哪裡。”鍾南迴答。
“何以見得？”李如鬆繼續發問。
“倭軍才攻下朝鮮不久，哪裡有時間去大規模轉移糧草，所以無論他們願不願意，都只能使用之前的糧倉；至於朝鮮的大糧倉在哪裡，相信無論朝鮮國王還是他們的大將應該沒誰不知道吧！”鍾南的說法的確讓人無法反駁，李如鬆對這個傢伙是越來越欣賞了。
“既然這個方案是你想出來的，那燒糧草的任務你可敢接嗎？”李如鬆笑道。
“有何不敢，曹孟德夜襲烏巢不就是先例嗎！”鍾南並不怵。
“好好好……”李如鬆大笑，“那本帥給你五百人馬，等你凱旋歸來！”
鍾南語氣淡淡地說道：“那就麻煩大帥打聽好糧倉的位置，我先去挑人。”
“沒問題，整個東征大軍中的人馬隨你挑選！”
“多謝大帥，煩請大帥給我挑選三百遼東精騎，我再自青州營裡挑兩百個兄弟即可。”鍾南簡單的兩句話就確定了人選，隨後轉身告辭，一點也不拖泥帶水。
當天夜裡，鍾南帶着五百人馬，馬裹蹄人銜枚，藉着夜色靜悄悄地來到了龍山大倉。龍山大倉是原來的朝鮮國家糧倉，積貯了朝鮮數十年的糧食，漢城被倭軍佔領後無法轉移，於是就地徵用，包括之後倭軍收刮的糧草也大多儲藏於此。鍾南的這支敢死隊到達龍山後，發現倭軍對糧倉的防守並不十分嚴密，不知是沒來得及還是覺得不需要，他暗道一聲“天助我也”，隨後一馬當先衝了進去，並將第一支火箭射向了其中的一個糧倉，身邊的明軍也快馬加鞭，衝進營地後如法炮製，將火箭射向了每一個糧倉。
轉眼間，十三座大倉便燃起了熊熊大火，駐守的倭將大驚失色，一邊派人救火，一邊派人誅殺明軍敢死隊。鍾南讓大家繼續發射火箭，直到每個人都射光了隨身攜帶的箭矢才罷休，看着吞天的火勢，他知道倭軍再怎麼救火也沒用了，這數十萬石糧食，將會被燒的一乾二淨。只是沒想到這一耽擱，倭軍便圍了上來，少說也有一兩千人，估計是護衛糧食的所有倭軍。
倭軍將士深知龍山大倉的重要性，這羣人從上至下都明白：糧草被燒，他們肯定難逃軍法處置，於是人人都發起瘋來，不要命地纏着敢死隊。鍾南見此情形，果斷讓遼東精騎先行撤退，自己帶着青州兵斷後，五百人馬不敢戀戰，且戰且退，好不容易纔逃出城外。鍾南清點了一下人馬，發現只剩下不到一百五十人，而且活下來的幾乎個個帶傷，連他的肩部都被火繩槍擊中，額頭上也有一處倭軍箭矢留下的傷口，幸運的是都不致命。想到三百多個弟兄就這樣埋骨他鄉，鍾南心裡唏噓不已，不過眼下不是矯情的時候，他沒多做停留，招呼着剩餘的弟兄們馬不停蹄地趕回了明軍大營。
大營門口，李如鬆正帶着所有的高層將領們，焦急地等待着消息，當稀稀拉拉的馬蹄聲傳來時，衆人精神爲之一震。遠遠望去，只見鍾南帶着爲數不多的明軍正向他們騎來，雖然兵稀馬少，卻沒有半分頹廢之色。距離將近時，鍾南揮動馬鞭，加快速度來到諸位將領面前，隨後躍下馬來，對着李如鬆等人半跪拱手說道：“大帥，諸位將軍，我等幸不辱命！”
“好，好，好！”李如鬆仰天長嘯，“鍾南，你再立奇功，本帥決不食言，定當親自向皇上爲你請功！另外今晚參戰的所有士兵，也都統統有賞！”
“謝大帥，謝皇上！”餘下的敢死隊成員們大聲迴應。
龍山一戰後，明軍扭轉了勢均力敵的態勢，倭軍糧草一失，全線被動，陷入了前所未有的困境，雖然之後和明軍又打了數場小仗，氣焰卻遠不如初時那般囂張了。想想也是，倭軍初入朝鮮時，僅陸上士兵就有九萬六千餘人，當各隊重新在漢城集結時，剩下的還不到五萬三千人，減員四萬三千餘人，佔總數的百分之四十五左右，近半的折損率幾乎都是明軍造成的。
同時倭軍在海上也沒討到多少便宜，儘管大明王朝沒有派遣水師將士，可是他們卻被朝鮮名將李舜臣的“龜甲船”折磨得苦不堪言，想在海上佔得便宜的打算也落了空。如今倭軍減員嚴重，再加上糧倉被焚，軍心越來越不穩定，一番權衡過後，豐臣秀吉主張雙方議和。
明軍在碧蹄館之戰後銳氣受挫，而且兵力遠少於倭軍，除非再次增兵，不然也並不具備再次決戰的條件。時任兵部尚書石星是主和派代表人物，他反對對朝增兵，皇帝也被說動了。既然雙方都不想繼續打下去，那麼就有了議和的可能。
於是從三月中旬到四月中旬，兩國的和談在官員層面已經進行得差不多了，剩下的就是等待萬曆和豐臣秀吉批准了。不過這些事情對鍾南和其他前線的將士們來說，並無一絲意義，他們希望的只是可以早日回家。
四月十八日，倭軍全部撤離漢城，並交還了俘虜的朝鮮二王子，李如鬆於十九日率明軍及朝鮮軍進入漢城，五月十五日渡漢江進至慶州。在慶州對明軍、朝鮮軍和朝鮮義兵作了部署之後，李如鬆便返回京師。至此，除全羅和慶尚二道部分沿海地區爲倭軍佔領外，其餘各地全部收復。
七月底，明軍留下一萬人駐守朝鮮，餘下的東征援朝軍也終於載譽回國了。
八月中旬，鍾南等山東將士返回駐地，青州士兵略做休整後，施長廷便給大家放了長假。