解決了其他幾個國家的問題，最後就落到了葡萄牙。經過幾天和五國使節的接觸，朱顯波終於知道，只要大明的實力夠強，所謂的歐洲列強也只不過稱號。只要善於分割利益，諸國還是不會聯合起來對付大明的。那麼這個剛打敗的敵人，則要好好修理下，不然沒人知道大明厲害。
卡瓦略再次來到談判桌前，已經沒前幾天那麼犟了。一來大明的態度一如既往的強硬，二來其他五國的使節都陸續返回印度駐點了。只有法蘭西使節留了下來。大部分都撈到了好處滿意而歸，而他和葡萄牙幾千將士還沒有得到人身自由。
“尊敬的皇帝陛下，我們葡萄牙戰敗了，我們同意撤出馬六甲。但希望能保留葡萄牙在馬六甲的貿易機構。允許我們的戰艦返航。”
“你們盤駐馬六甲這麼多年，從東南亞掠走了多少金銀財寶。當初大明的商船你們都不讓進港貿易，如今我們收復了馬六甲，你們想一走了之？沒門，還是現實點談談賠償吧。你卡瓦略先生的命值多少錢。那幾千將士和他們的家屬呢？還有那些戰艦呢？我們大老遠的開着大批戰艦過來又產生多少費用？”
“這個，你們不要逼人太甚。我們葡萄牙的航海實力有目共睹的。”
“有目共睹就不要賠錢了嗎？你們難道不想回葡萄牙了嗎？只要你們願意做奴隸，朕也不在乎用船送你們去新大陸的。”
“皇帝陛下，這還是談判嗎？我們的戰艦不過是馬六甲海口攔截你們，我們的使節裡卡多被你們炮擊掉入海里下落不明。。。”卡瓦略已經再次被激怒了
“隨便你怎麼想。”
“卡瓦略先生，也許你還不知道吧。就在你們的裡卡多先生掉落海中後。你們的大炮也擊傷了我們的皇妃，她已經不治身亡了。”戚宏亮見卡瓦略說起裡卡多的事情，就忍不住想起了鍾雪，這個皇帝喜歡的女人，他說成皇妃不知道恰當不恰當。說完朝朱顯波看看，只見朱顯波臉上頓時變了，由白轉青，再由青轉黑，煞是難看。看來戚宏亮觸痛到他的傷口了。
卡瓦略也愣了下“對不起，皇帝陛下。戰爭是殘酷的，我們也希望葡萄牙和大明長期和睦。”本來這個總督先生想用使節的死減少點賠償，沒想到惹了更大的禍，一個使節和皇妃比起來根本不值一提，於是眼睛瞄瞄朱顯波。看到朱顯波的表情後，他就後悔了。
這個時候確實不應該提，本來戰場上死人是很正常的，朱顯波順利接應到李華梅後已經安排人將鍾雪海葬。沒想到這會被這個總督牽出，心中隱隱作痛，想起鍾雪那頑皮可愛得笑容，自己第一次和鍾雪見面那尷尬的情景。如今一切都香消玉殞了。一代佳人就這樣長眠於*大海，這是任何金銀財寶都補償不了的。
“不命人用再說了，就按人頭算，婦幼老少一個都不能漏。戰艦你們要就出造價的一半贖，不要朕命人拆了建設馬六甲!至於商貿和戰艦駐紮之事參照荷蘭！";說完拂袖而去。
卡瓦略和戚宏亮兩人你看看我，我看看你不知所措，朱顯波話到這個份上等於下了最後裁決。戚宏亮知道皇上的心思，這個葡萄牙被列爲頭號敵人對待了。
這邊卡瓦略並不完全知曉荷蘭與大明的談判，小心翼翼的說道：“戚大人，參照荷蘭是什麼個情況？”
“葡萄牙人和船隻不得進入馬六甲海峽，不允許在東南亞進行貿易。不過這些是要等你們交割萬賠款之後。在此之前是你們那裡也不能去。”戚宏亮將荷蘭人的待遇告訴了卡瓦略。
“這麼說來，大明是要長期將葡萄牙視爲敵人了。”
“沒錯，早點寫信去印度和葡萄牙，讓你們的國王拿錢來贖人吧。”
“沒有商量的餘地？”
“剛纔皇帝陛下的態度你也看到了。我們還是來商量下具體的賠償金額吧。戰艦你們還打算贖回嗎？”
。。。。。。
經過幾天數回合的討價還價，葡萄牙人終於低頭，畢竟還有幾千人在大明手裡，最後答應賠償大明戰爭損失。人員無論男女老少按三百兩白銀一個贖人，戰艦按三十萬兩一艘贖回。總計八百萬五十多萬兩白銀，葡萄牙從印度先行運兩百萬交付，大明收到這兩百萬後釋放所有俘虜。兩個月從葡萄牙本土運送三百萬兩，三百萬抵達後，大明歸還葡萄牙所有戰艦。剩餘三百五十兩年付清。同時請來了法蘭西使節做公證。
倘若兩年內還不清剩下三百五十萬，大明有權向葡萄牙索要南亞甚至非洲的殖民地。本來這法蘭西使節老大不情願，但既然大明做出了姿態，也表面上十分尊重法蘭西，就勉強答應了坐個公證。
且不說這公證如何有效，如果葡萄牙人一旦賴賬，朱顯波則可以趁機挑撥法葡之間的關係。總是大明也不是俺麼缺錢。留個伏筆未嘗不是件好事。
戰爭的事情解決後，朱顯波又讓人在馬六甲靠海邊選塊地給鍾雪修繕墳墓。立了個墓碑，墓碑上刻着：大明皇妃鍾雪之墓！兩旁是朱顯波親筆題詞：滄海茫茫，歲歲年年濤依舊；香冢默默，歲歲年年枉懸思。
朱顯波之所以要給從未入宮的鐘雪名份，一是戚宏亮的話提醒了他。這麼一個活波可愛的女孩子跟隨他這麼多年，甚至還要遠離大陸遠赴重洋在船上顛簸，帶領醫療隊四處救人。
當然最主要的是做給兩部分人看，一時大明的這些特戰部隊，看大明皇上是一個多麼重情義的人。另外就是給那些戰敗的葡萄牙人看，讓他們知道自己惹了大禍，殺了大明的皇妃。
等到袁承志和吳三桂把馬六甲城多次清理後，戚宏亮來回報“皇上，此次在葡萄牙總督府和各貴族、官員家中共抄獲白銀二百萬兩，黃金三萬兩，奇貨珠寶無數。”
“拿些珠寶賞給此次作戰有功的將士們。另外陣亡的將士要在馬六甲立碑，並負責家人來探親的來回費用。當初要是知道這麼快能拿下馬六甲，朕就不下令進行海葬了。”朱顯波惆悵的低下了頭。
“皇上，水師在大海上位朝廷立功，海葬是他們的榮耀。”
“抓緊去辦理各種雜務吧，等到葡萄牙人的第一批銀兩到後，你跟朕回京。第二批銀兩留給馬六甲的海港和城防建設以及日常開支。
“皇上，馬六甲建設不需要這麼多銀兩吧。”
“從阿鎮開始沿途多建設幾個海港，比如蘇門答臘島上。如果有些海港人口不多久建設成軍事島嶼。另外這馬六甲和東南亞需要重新佈防，你看誰該如何分配艦隊和戰船啊？”
“目前真正屬於我們統治的還只有馬尼拉和馬六甲，雅加達屬於和爪哇合作性質。因此微臣以爲還是應該將兩支艦隊分別部署在馬六甲和馬尼拉。遠洋艦隊負責馬六甲及整個海峽的巡防。南海艦隊負責從馬尼拉到雅加達等一線的巡防。東海艦隊可以駐守臺灣淡水港作爲機動。“
“爲了更好的治理馬六甲及周邊地區，朕想將袁承志和姚啓聖留在這裡。同時擢升穆友前和傷不起爲兩地總督仿效洋人。你看如何？”
“吾皇聖明，雖然各國表面上都和大明簽訂了和約，但荷蘭和葡萄牙不一定會死心，適當的留一些步兵和騎兵在馬六甲也是必須的。將來阿鎮還需要人駐防。”
“那就這樣定了，吳三桂仍舊回雲南。各艦隊的配置暫時不變，對於借道給我們的邂邏、高棉等國可以適當減免他們今年的進貢。”
就這樣，淪陷三十多年的馬六甲再一次回到了大明手中，更重要的是三次大海戰嚴重削弱了葡萄牙的水師實力。也讓歐洲六國第一次真正見識了大明的水師戰鬥力和遠程投送能力。
對於朱顯波來說另外一個收穫就是說服了李華梅跟自己回京，因爲這次馬六甲海戰之後地球人都知道了所謂的李家海盜其實就是大明的艦隊。想再渾水摸魚是不可能的了。再說，大明的三隻艦隊進入了東南亞，再有明朝海盜四處掠奪也說不過去了。朱顯波也無法向那些年年向自己納貢的小王朝.