在秦鋒的威懾之下，下場的秩序有所好轉，但是當時聚集在下關碼頭的人實在太多了，而且城內仍然不斷的有人涌到下關碼頭，使得現場仍然十分的混亂。
在獨立團士兵的指揮下，潰兵和逃難的百姓開始分批上船，船隻相繼駛離碼頭開赴對岸。經過這幾天的努力，獨立團收集了大量的船隻，但是一次性也最多隻能裝載幾千人過江，然而下關碼頭聚集的人實在太多了，短時間內也根本無法將所有人全都運到對岸。
於此同時，逃到下關的部隊和百姓也在想盡一切辦法渡江，馬嘶人喊，人員嘈雜，傷兵勉強拄着棍子也跟在後面。碼頭上的人如同熱鍋上的螞蟻，亂成一團。第74軍軍長俞濟時有路子找了1艘小火輪1次可以裝300多人，不間斷的開始運輸潰兵過江。第88師第264旅的輜重營在下關控制着一批木船，也在抓緊時間搶運第88師的潰兵。教導總隊和第36師也都分別控制了一批船隻，馬不停蹄的將潰敗下來的部隊不斷的運到江北，然而船隻還是太少了，大多數人根本無船可渡。
有的人等不到船隻，便拆卸門板等物，自己動手扎建簡易的木筏準備渡江，甚至是泅渡過江，然而只有少數人成功，許多人因爲江流洶涌，又不善游泳，而被活活淹死。
也並不是所有的部隊都違抗命令撤往了下關碼頭，屬於粵系的第66軍和第83軍一部在軍長葉肇和鄧龍光帶領下向正面突圍，在付出巨大代價後成功突破日軍包圍，第159師代師長羅策羣戰死。當時日軍雖然包圍了南京，但是後方卻是空虛的，因此這些部隊在突破了鬼子的阻擊之後，反而成功的突圍到了後方。
而且有的高級將領在開完會之後，就提前跑路了，根本不顧下面士兵的死活，導致一些部隊根本不知道撤退的命令。例如教導總隊第三旅，當天夜裡還在紫金山與日寇拼死搏殺，根本不知道撤退的事情，等到其他部隊都撤走了，旅長馬威龍才得知消息，隨後帶着部隊穿過敵人的間隙突圍，轉移至皖南一帶集結待命。
在下關碼頭，秦鋒見到了憲兵司令蕭山令將軍，此時蕭將軍正帶着手下的憲兵負責維持秩序，指揮部隊過江。得知獨立團趕到下關的消息之後，蕭將軍特意找到了秦鋒，在兩人的共同努力下，下關的秩序才得以恢復了一些，沒有產生更大的混亂。
經過一夜的忙碌之後，在獨立團的努力下，聚集在下關碼頭的數萬軍民得以成功渡過長江，然而此時下關碼頭上，還聚集着大量的潰兵和逃難的民衆來不及過江。
因烏龍山要塞守軍撤走，原停泊於草鞋峽、三臺洞（燕子磯南）的“文天祥”魚雷快艇中隊（4艘）也於12日夜馳去大通，12月13日拂曉，日軍山田支隊未經戰鬥即佔領了烏龍山；日海軍艦艇通過封鎖線到達下關江面，日軍第16師團一部亦乘舟艇進至八卦洲附近江面。大量正在渡江的中**隊官兵被日海軍及第16師團的火力和艦艇的衝撞所殺傷，情況變得萬分危急。
秦鋒聽到遠處突然響起的槍聲忍不住皺起了眉頭，這時一名士兵急急忙忙的跑了過來，一臉焦急的說道：“報告團座，有一股小鬼子突然追了過來，蕭司令正指揮憲兵部隊阻止日寇，然而日寇攻勢甚猛，恐怕難以維持。李副團座已經帶着四營，五營和機炮營的弟兄們趕去支援了。”
秦鋒聞言眉頭皺的更深了，隨即將劉建國和劉嘉裕叫了過來，吩咐他們繼續留下來組織未渡江的人們儘快渡江北上，隨後親自率領第三營，緊急趕往前線阻擊日軍。
秦鋒帶着三營趕到戰場的時候，只見遠處大量的小鬼子，正沿着江岸向着這邊衝殺了過來，中**隊就地構築起了一條臨時防線，暫時擋住了小鬼子，戰事非常的激烈。
秦鋒立刻舉起了手中的盒子炮，大聲吼道：“弟兄們！給老子上！將小鬼子打下去。”說着一馬當先的衝上了戰場，三營的弟兄們也跟着一起衝了過去。
秦鋒直接衝上了硝煙瀰漫的戰場，趴在一處凹地，舉起盒子炮對着衝上來的小鬼子扣動了扳機，同時大聲喊道：“弟兄們！給老子狠狠的打！”
一聲聲清脆的槍聲響起，衝上來的小鬼子一個接一個的中槍倒地，李長富已經帶着四營五營和機炮營的弟兄們提前趕到了戰場，獨立團突然加入戰鬥，使得我軍的火力猛然增加了不少。
小鬼子雖然兇殘，但是在我軍猛烈的火力壓制下，一時間也無法衝過來，戰場上已經鋪滿了雙方士兵的屍體。進攻受阻，鬼子們也沒有輕易的放棄，仍然不顧一切的發動着進攻。
此時天已經逐漸的亮了，看着不遠處那些兇殘的小鬼子，秦鋒心中的怒火便無法壓制，雙手各持一支盒子炮不停的開槍射擊，一顆顆致命的子彈飛射而出，將一個個小鬼子直接送進了地獄。
在中**隊的頑強抵抗下，小鬼子損失慘重，被迫暫時停止了進攻。見小鬼子終於被打退了，秦鋒忍不住鬆了一口氣。
戰事稍歇，秦鋒連忙命令部隊，加固陣地，防止小鬼子再次發動進攻。
這時候蕭山令將軍找到了秦鋒，皺着眉頭問道：“秦老弟！現在碼頭上還有多少人？什麼時候才能全部過江？”
秦鋒皺着眉頭說道：“還剩下不少人，恐怕短時間內無法全部運輸過江，咱們必須擋住這些小鬼子，最少也要擋住他們幾個小時，以保證更多的人能夠順利過江。”
“瑪的！”蕭山令忍不住怒罵了一聲，皺着眉頭說道：“小鬼子兵力衆多，我們兵力有限，且沒有堅固的防禦工事作爲依託，恐怕很難堅持太長的時間，秦老弟，你立刻回去組織一些潰兵前來幫忙，無論如何也要暫時擋住小鬼子。”